A Chapada dos Veadeiros abriga fauna e flora  típicas do Cerrado brasileiro.

            As rochas encontradas na Chapada dos Veadeiros originaram solos relativamente pobres. E em suas áreas de reduto, ou seja, as veredas, matas de galeria, áreas pantanosas e matas ciliares, encontram-se todas as classes de animais e vegetação. O clima do cerrado classifica-se como tropical de altitude, composto de duas estações: a seca e a chuvosa.    

               O cerrado possui cerca de 60.000 espécies de insetos, 935 de aves, 298 de mamíferos e 238 de répteis.
Muito embora ainda não exista um levantamento da fauna do Parque Nacional da Chapada dos Veadeiros, pode-se destacar as principais espécies de animais ali encontradas, como o Cervo-do-Pantanal (Blastocerus dichtomus), que habita as regiões mais próximas aos rios, o Veado-Campeiro (Ozotocerus bezoarticus), a Onça Pintada (Panthera onca), o Lobo Guará (Chrysocyum brachyurus) (todos estes ameaçados de extinção), o Tapeti (Sylvilagus brasiliensis), o Tatu-Canastra (Priodontes giganteus), o Tamanduá Bandeira (Myemecophaga tridactyla), a Ema (Rhea americana), a Capivara (Hidrochaeris hidrochaeris), a Anta (Tapirus terrestris). Há ainda o exuberante Tucano de Bico Verde (Ramphastos dicolorus), o Urubu Rei (Sarcoramphas papa), o Urubu Preto (Coragyps atratus).

           As árvores do cerrado possuem forma sinuosa e torta, devido à presença ou ausência de água e nutrientes. Nas partes mais altas predomina o latossolo amarelo, seguindo-se o vermelho, o vermelho escuro, o cinza e o negro. As folhas em geral são caducifólias, caindo durante o período da seca para evitar a perda de água pelas plantas. Caracterizam-se também suas folhas por serem felposas, pilosas e cerosas.

               Nas florestas-de-galeria as espécies mais encontradas são: Pau d’Arco Roxo (Tabebuia ipe), a Copaíba (Copaifera grandifolia), a Aroeira (Astronium urundeuva) e a Tamanqueira (Stryphnodendron sp). Encontra-se ainda o Jerivá (Arecastrum romanzaffianum) , a Viuvinha (Jacaranda brasiliana) e, nas partes baixas, os Buritis (Mauritia sp) e o Babaçu (Orbignya martiana). Fora da parte coberta com floresta de galeria destacam-se o Pau Terra Vermelho (Qualea multifolia), a Lixeira (Curatella americana), o Murici rói rói (Byrsonima cocaldsifolia), o Caju do Campo (Anacardium sp) e Mandioqueiras (Quaiba spp).